The Three Stooges menerima ulasan negatif. Pemeran Jersey Shore masing-masing dinominasikan dalam Razzie Awards 2013 untuk “Pasangan Layar Terburuk” untuk pekerjaan mereka di film ini, tetapi kalah dari Mackenzie Foy dan Taylor Lautner dari The Twilight Saga: Breaking Dawn – Part 2. Film ini menerima nominasi untuk “Film Terburuk” dalam Houston Film Critics Society 2013.
Pada tanggal 7 Mei 2015, sekuel diumumkan, produksi akan dimulai pada tahun 2018 tetapi rencana untuk sekuelnya dibatalkan. Namun, diumumkan pada Desember 2021 bahwa pengembangan sekuel telah dimulai kembali.
■ Kritik untuk Anti-Katolik
Bill Donohue, presiden organisasi anti-fitnah Liga Katolik, merilis sebuah pernyataan yang mengutuk film ini dengan alasan penggambaran yang tidak sopan terhadap umat Katolik, khususnya para suster/ biarawati. Donohue mengklaim bahwa film ini adalah bukti meningkatnya permusuhan terhadap agama dan Katolik di Hollywood, berkomentar “Pada 1950-an, Hollywood umumnya menghindari tarif kasar dan menghormati agama. Hari ini, mengkhususkan diri dalam kekasaran dan sampah Kristen, terutama Katolik.” Donohue menambahkan bahwa film “bukan hanya remake lain, itu adalah penanda budaya signifikansi sosiologis, dan apa yang dikatakan tentang cara kita berubah tidak menyenangkan.“
Donohue menunjukkan dengan tepat satu adegan di mana film dengan penggambaran dua biarawati yang tidak biasa, masing-masing digambarkan oleh model Kate Upton, dan bintang/ pencipta Curb Your Enthusiasm, Larry David. Keduanya merupakan penyebab potensial pelanggaran karena alasan yang berbeda, seperti yang dilaporkan Moviefone:
Dalam Stooges, David memerankan Suster Mary-Mengele. Nama itu merujuk pada mendiang Nazi Josef Mengele, seorang Perwira SS yang menentukan nasib para tahanan di Auschwitz. Adapun Upton, bukan nama karakternya, Sister Bernice, tetapi pakaiannya. Dalam satu adegan, model baju renang Sports Illustrated ini mengenakan bikini yang sangat terbuka bersama dengan rosario besar di lehernya.
Untuk mengatasi masalah ini, Farelly bersaudara merekam ulang adegan dengan Larry menunjuk Suster Bernice, masih mengenakan “bikini biarawati” saat bertugas sebagai penjaga di kolam panti asuhan yang baru. Cuplikan close-up dari Kate Upton keluar dari kolam di depan sekelompok anak-anak muncul di trailer film, tetapi tidak di film ini sendiri atau DVD/Blu-ray delete scene.